El tratamiento de la Hiperhidrosis Severa y de las personas que no responden al tratamiento dermatológico en cara, axila y manos está reservado al Cirujano Torácico.
La cirugía es el tratamiento con mejores resultados disponible en la actualidad, consiste en la simpatectomía o simpaticotomía, procedimiento en el que se seccionan las cadenas formadas por el nervio simpático por su paso a través del tórax con el fin de bloquear permanentemente los estímulos cerebrales hacia las glándulas sudoríparas. Esta técnica se realiza hoy en día por video toracoscopía y su principal ventaja es la inmediata resolución de la hipersudoración.
La Hiperhidrosis plantar aún se encuentra fuera del alcance de la cirugía, para lo cual se está investigando una técnica quirúrgica segura y eficaz.